Follow us:

资源

  • 生物大数据 科研案例 技术支持 服务流程
  • microRNA研究软件


    ·         SeqBuster:http://seqcluster.readthedocs.org/mirna_annotation.html
    a bioinformatic web interface able to custom analyze deep sequencing data to study miRNA variants or isomiRs. From Genetic Causes of Disease Group, Genes and Disease Program, Centre for Genomic Regulation (CRG), Pompeu Fabra University, Barcelona, Catalonia, Spain.
    ·         WMD3: http://wmd3.weigelworld.org./cgi-bin/webapp.cgi?
    WMD3 designs artificial microRNAs (amiRNAs). The 21mer amiRNA21mers can specifically silenceg single or multiple genes of interest in more than 90 plants. From Max Planck Institute for Developmental Biology, 72076 Tübingen, Germany.
    ·         TargetScan:http://www.targetscan.org/
    TargetScan是通过搜索和每条miRNA种子区域匹配的保守的8mer和7mer位点来预测靶基因。美国Whitehead生物医学研究所信息和研究计算
    ·         microRNA.org:http://www.microrna.org/
    miRanda数据库提供了关于人类、果蝇和斑马鱼基因组的microRNA靶目标的预测信息以及miRNA在不同组织的表达谱。美国Memorial Sloan - Kettering癌症中心(MSKCC计算生物学中心
    ·         PicTar: http://www.pictar.org/
    icTar是通过一定计算法则来鉴定microRNA的靶目标的。该可搜索的网站可以提供以下物种的关于microRNA靶目标的预测详细信息,包括:脊椎动物、七个果蝇种类、三个线虫种类和人类的非保守但共表达的microRNA的靶目标(例如:表达在同一组织的microRNA和mRNA)。德国柏林马克斯德尔布吕中心和纽约大学比较功能基因组学Rajewsky实验室
    ·         RNAhybrid:http://bibiserv.techfak.uni-bielefeld.de/rnahybrid/
    RNAhybrid是一种用于寻找一条长链RNA和一条短链RNA的最小配对自由能的工具,是通过一种域码来实现的。例如一条短链序列结合到长链的最佳位置上。该工具主要作为microRNA靶基因预测用. 德国Bielefeld大学
    ·         microInspector:http://bioinfo.uni-plovdiv.bg/microinspector/
    microInspector提供miRNA结合位点的预测。 希腊伊拉克利翁分子生物学和生物技术研究所和保加利亚普罗夫迪夫大学
    ·         TripletSVM: http://bioinfo.au.tsinghua.edu.cn/mirnasvm/
    TripletSVM是一个用于预测一个具有发夹结构的被查询序列是否是一个真正的miRNA前体物的程序. 中国北京清华大学




    更多了解产品和解决方案>>
    美好杏园你我共创