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    基于酶切的简化基因组测序
    Restriction-site associated DNA-sequnencing , RAD sequencing
            
    简称简化基因组测序,是指利用限制性内切酶对基因组进行酶切,对产生的酶切DNA片段进行文库构建,然后对其进行高通量测序的技术。
    RAD-seq能够大幅降低基因组的复杂度,可以快速鉴定基因组DNA变异(如SNP)的信息,用于群体进化、多态性图谱、遗传图谱构建(QTL 定位)、性状关联分析,以及在基因组从头测序项目中辅助scaffold 组装到染色体。
    对没有参考基因组的物种而言,RAD-seq技术不受已知基因组序列的限制,即可大规模筛查SNP位点;基因组的复杂度被大幅降低,从而降低了测序成本,因而特别适合在群体水平进行研究;传统的技术在获得SNP位点信息之后,需要通过设计相应引物,再利用基因分型技术对每个样本进行分型,而RAD-seq技术在获得SNP位点信息的同时,也就获得了每个样本的基因型。对有参考基因组的物种而言,数据分析更加简便,并且能够有效开发新的SNP位点。另外,我们可以在测序前,通过对限制性内切酶进行选择,灵活调整Tags的复杂度,适应不同的研究需要。

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