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    泛基因组测序(Pan-genome sequencing)
     
    2005 年,Tettelin H 等人提出了微生物的泛基因组概念(Pan-genome,pan 源自希腊语‘παν’,全部的意思),泛基因组包括核心基因组(Core genome)和非必须基因组(Dispensable genome)。其中,核心基因组指的是在所有菌株中都存在的基因;非必须基因组指的是仅在部分菌株中存在的基因。2009 年,Li R 等人首次采用新全基因组组装方法对多个人类个体基因组进行拼接,发现了个体独有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“人类泛基因组”的概念,即人类群体基因序列的总和。2009 年泛基因组测序首次应用于人类基因组学研究;2013 年泛基因组测序应用于动植物研究领域。
    泛基因组测序是运用高通量测序及生物信息分析手段,针对不同亚种/个体材料进行测序及泛组装,构建泛基因组图谱,丰富该物种的遗传信息。泛基因组测序不仅可以获得多个基因组,完善该物种的基因集,还可以获得种群甚至个体特有的DNA 序列和功能基因信息,为系统进化分析及功能生物学研究奠定基础。
    选择不同亚种材料进行泛基因组测序,可以研究物种的起源及演化等重要生物学问题;       选择野生种和栽培种等不同特性的种质资源进行泛基因组测序,可以发掘重要性状相关的基因资源,为科学育种提供指导;选择不同生态地理类型的种质资源进行泛基因组测序,可以开展物种的适应性进化,外来物种入侵性等热门科学问题的研究,为分子生态学等学科提供新的研究手段。

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