Follow us:

高通量测序

  • 靶向捕获测序
  • 循环肿瘤DNA测序
  • 转录组测序
  • 外显子组测序
  • 生物芯片

  • 蛋白芯片
  • miRNA PCR芯片
  • 基因表达PCR芯片
  • 表达谱基因芯片
  • 基因突变和拷贝数变化P
  • 生物信息数据挖掘

  • 高通量测序数据挖掘
  • 生物芯片数据挖掘
  • 高通量数据验证

  • Realtime PCR实验
  • Sanger测序
  • ELISA实验
  • WB实验
  • > 技术服务 > 生物芯片 > 表达谱基因芯片
    全基因组表达谱芯片,是将针对全部基因(或者全转录本)设计的探针通过原位合成的技术固定在玻片上,通过芯片杂交、扫描等技术检测基因表达、可变剪切的技术。
    您仅仅需要提供细胞或者组织样品,上海杏园生物科技有限公司即可为您提供基因表达检测的高通量筛选及后续的数据分析。

    • 产品种类齐全:杏园生物提供的表达谱芯片包括以下三种
    1. 针对全部mRNA表达的芯片:上海杏园生物科技有限公司针对专门针对性检测mRNA表达的客户,提供的芯片是基于3’端设计多对探针的全基因组表达谱芯片,这类芯片主要应用基因表达的检测。
    2. 针对mRNA表达和可变剪切的芯片:RNA的可变剪切可以导致产生不同的转录本,并导致翻译编码形成多种蛋白,可变剪切是调节基因表达和产生蛋白质多样性的重要机制。据估计人类基因组出现可变剪切的几率高达60%。这些可变剪切不但在正常细胞表达调控、个体分化发育中作用重大,而且与人类许多系统的疾病甚至肿瘤等密切相关。上海杏园生物科技有限公司依托Affymetrix技术平台,提供可以区分不同剪切变异体的全基因组表达芯片,在提供基因表达量的同时也明确了可变剪切形式,更加准确地或者不同转录本的表达量。从而为下一步的研究打好基础。
    1. 同时包含mRNA和ncRNA的芯片:mRNA具有翻译形成蛋白质的功能,但是ncRNA经过研究发现也有着十分重要的调控功能,因此在疾病和发育的过程中也起着十分重要的作用。上海杏园生物科技有限公司提供的全基因组表达谱芯片也可以一次性检测mRNA和ncRNA的表达和可变剪切,从而给研究人员更多信息,为研究开拓更多方向提供很好的提示。
    •    实验质控严格:杏园生物采用Labchip技术对RNA样品进行质量检测;
    •    稳定性好:全封闭式操作系统,全自动化操作流程,实验结果更加稳定;
    •    数据分析优势:数据分析免费,而且种类齐全,包括差异表达分析、聚类分析、功能和生物学通路分析、基因网络分析。
             
    实验样品:新鲜组织、冰冻组织、悬浮细胞、贴壁细胞、RNA样品

    工作流程:


     

    研究实例
    研究摘要
    Circulating free fatty acids are often elevated in patients with type 2 diabetes (T2D) and obese individuals. Chronic exposure to high levels of saturated fatty acids has detrimental effects on islet function and insulin secretion. Altered gene expression and epigenetics may contribute to T2D and obesity. However, there is limited information on whether fatty acids alter the genome-wide transcriptome profile in conjunction with DNA methylation patterns in human pancreatic islets. To dissect the molecular mechanisms linking lipotoxicity to impaired insulin secretion, we investigated the effects of a 48 h palmitate treatment in vitro on genome-wide mRNA expression and DNA methylation patterns in human pancreatic islets.
    游离脂肪酸通常在Ⅱ型糖尿病人和肥胖的人群中是上调的。长期暴露在高水平的饱和脂肪酸中会对胰岛的功能和胰岛素的分泌造成不利的影响。基因表达的改变和表观遗传的变异可能是导致Ⅱ型糖尿病和肥胖的原因之一。但是对于脂肪酸是否影响人胰岛的基因组转录谱以及DNA甲基化模式还知之甚少。为了揭示脂毒性与胰岛素分泌降低之间的分子机制,本文研究了棕榈酸盐处理48小时后人胰岛的基因组mRNA表达谱和DNA甲基化模式。


    研究思路
    a.  人胰岛脂毒性研究实验设计框架图
    b.  人胰岛用棕榈酸盐处理后mRNA表达和DNA甲基化数据分析工作流程图
     
    结果展示
    用棕榈酸盐处理后人胰岛差异表达的基因分析  
    a)  所有差异表达的基因 b)下调的基因  c)上调的基因
     
    (Hall et al. BMC Medicine, 2014, 12:103)

    我们将提供给您一份专业、全面和易于理解的数据报告:
    1、样品和实验质控确保实验的准确性
     
    2、检测结果
    1)芯片原始图片和原始数据。
    2)客户指定分组的差异比较结果,包括标准化,两两分组比较,生物学重复三次以上可计算P-value。
    3)根据实验结果绘制Scatter Plot,生物学重复三次以上可计算Volcano Plot。
    4)Go & Pathway分析,找到与疾病和信号通路相关的差异蛋白,判断其是否具有显著意义。
     
    3、详细而清晰的工作流程
    1)实验流程
    2)数据分析流程
     
    在实验过程中,我们会及时向您反馈实验进程。实验结果交付后,我们会主动为您解读实验报告。



    更多了解产品和解决方案>>
    美好杏园你我共创