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高通量测序

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  • 外显子组测序
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    高通量测序和全基因组表达芯片产生了超大量数据,由此引发了研究人员对于中等通量验证服务,及针对性研究某一类基因表达技术服务的需求。功能分类PCR芯片具有准确度高,实验操作简便,产品多样化的特点,很好的满足了各种疾病和信号通路特异性研究的需要。
    上海杏园生物提供的基于Taqman探针法和SYBR Green法的Real time PCR芯片实验,以其优秀的品质、精准的检测结果,成为您科研工作的助力。

     -  高通量:可同时检测成百上千个样品,多基因检测时间与过去检测单个基因相似。
     -  低污染:引物预固定于固相支持物上,防止不同引物对之间气溶胶污染。
     -  数据全面、可靠:芯片包含的基因来自公共权威数据库、综述和相关文献。
     -  对照全面:5个管家基因,1个基因组DNA对照(GDC),3个反转录对照(RTC)和3个阳性对照(PPC)。
     -  特异性强:杏园公司每对引物和探针都经过严格的质量控制,在传统质检的基础上采用PerkinElmer公司的LabChip对每一个PCR产物进行分析,区分度可达到4-5bp,保证引物的特异性。

     -  结果稳定:公司采用GMP/GLP标准建设实验室,并引入精益六西格玛(Lean-Six Sigma)管理方法严格执行ISO质控标准体系,逐环节细致实施标准操作规范,全过程监控实验的每一步骤,公司积极运用精益六西格玛工具与方法,不断优化生产、服务流程,确保快速、准确、高质、稳定地为每一位客户提供服务优质、可靠而且真实的实验报告。

     
               下图展示了我们每条引物都进行的PCR产物质检图,我们采用PE公司的Labchip进行质检,区分度可以高达4-5bp。我们在传统质检的基础上加入此质检,更加保证了我们的引物的特异性。

                 

    杏园生物专业提供各类疾病及通路特异性PCR芯片技术服务。公司采用基于Taqman技术和SYBR Green技术的PCR检测平台,具备高重复性、高灵敏度、高特异性等优势。帮助您实现实验方案设计、芯片检测、数据分析,及后期功能研究的全套技术服务,并为您提供符合文献发表要求的数据报告。



     
    杏园生物PCR芯片技术服务项目
    - 人、小鼠、大鼠PCR芯片
    ▪ 凋亡 Apoptosis
    ▪ 生物标志物相关通路 Biomarkers Related Pathway
    ▪ 癌症 Cancer
    ▪ 细胞周期增殖与调控 Cell Cycle Proliferation and Regulation
    ▪ 发育与干细胞 Development and Stem Cells
    ▪ 细胞外基质与粘附 ECM Matrix and Adhesion
    ▪ 内源对照 Endogenous Controls
    ▪ 免疫系统和炎症 Immune System and Infl ammation
    ▪ 神经学 Neurology
    ▪ 复制 Reproduction
    ▪ 信号转导 Signal Transduction
    ▪ 毒理学和药物代谢 Toxicology and Drug Metabolism
    - 定制PCR芯片

    应用实例
    研究摘要
    Bone marrow transplantation is the primary therapy for numerous hematopoietic disorders. The efficiency of bone marrow transplantation depends on the function of long-term hematopoietic stem cells (LT-HSCs), which is markedly influenced by their hypoxic niche. Survival in this lowoxygen microenvironment requires significant metabolic adaptation. Here, we show that LT-HSCs utilize glycolysis instead of mitochondrial oxidative phosphorylation to meet their energy demands. We used flow cytometry to identify a unique low mitochondrial activity/glycolysisdependent subpopulation that houses the majority of hematopoietic progenitors and LT-HSCs. Finally, we demonstrate that Meis1 and Hif-1α are markedly enriched in LT-HSCs and that Meis1 regulates HSC metabolism through transcriptional activation of Hif-1α. These findings reveal an important transcriptional network that regulates HSC metabolism.
    骨髓移植是大多数造血系统病变的主要治疗方法。骨髓移植的疗效取决于长程造血干细胞(LT-HSCs)。在低氧的微环境中存活需要在代谢上做出重大的适应性调整。在本研究中,我们发现LT-HSCs利用糖酵解取代线粒体的氧化磷酸化来满足能量的需要。我们使用流式细胞仪鉴定了一类低线粒体活性,糖酵解依赖的细胞亚群,是造血前体细胞和LT-HSCs的主要成分。本实验证明Meis1和Hif1α在LT-HSCs细胞中富集,Meis1通过转录激活Hif1α来调控造血干细胞的代谢。这一发现揭示了重要的在转录水平上调控造血干细胞代谢的通路。
     

    结果展示
       使用缺氧通路相关的PCR array对高低代谢型细胞做了一个定量对比,线粒体活性低的造血干细胞中,很多和缺氧应激相关的基因表达量是明显增高的,特别是发现了重要的转录因子HIF1a,研究者从该基因入手,后续又做了一系列的实验,证明造血干细胞的缺氧耐受确实是以HIF1a为核心来发挥作用的。
     

    1. 中英文实验步骤
     2. 样品质控报告
     3. 溶解曲线和扩增曲线图
     4. 原始值
     5. 数据分析:

    1. 基因表达数据列表
    pcr芯片结果.png
    1. 散点图
    散点图.png
    1. 火山图
    火山图.png
    1. 3D图
    3D图.png
    1. 基因网络分析(可选)
    基因网络分析.png
     



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