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  • > 技术服务 > 生物芯片 > 基因突变和拷贝数变化PCR芯片
            检测细胞系或者样品的基因突变是癌症研究、毒理学和药物研发的关键内容之一,Real-time PCR是检测DNA突变的灵敏可靠的方法。通过将等位基因特异性扩增和水解探针检测相结合,突变位点特异的PCR芯片可以检测疾病相关或者信号通路相关的基因突变。
           拷贝数变异(Copy Number Variation, CNV)是基因组发生重排而导致的,一般指长度1kb以上的基因组大片段的拷贝数增加或者减少,主要表现为亚显微水平的缺失和重复。CNV包含的信息至少是SNP的三倍,因为CNV内部含有基因,所以它在人类疾病和药物应答中起重要的作用。呈孟德尔遗传的单基因遗传病及一些罕见复杂的疾病都与其相关,基因复制量改变、基因断裂、 融合及位置改变都可能是它的致病机理。基于Real-time PCR技术的PCR芯片可以检测疾病相关或者信号通路相关的基因拷贝数变化。

    检测基因突变的PCR芯片
    -等位基因特异性扩增和水解探针检测相结合,保证特异性
    -基于ARMS®技术的引物可以特异性扩增含突变位点的靶序列
    -可检测在野生型基因组DNA背景下低至1%的体细胞突变
    -能检测福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)样本
    检测拷贝数变异的PCR芯片
    -采用Multicopy Reference Assay作为DNA input normalization
    -即用型SYBR PCR Mastermix经优化,保证位点特异性扩增
    -可检测新鲜、冷冻或者福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本

    检测基因突变和拷贝数变化的PCR芯片
     
    杏园生物专业提供各类疾病及通路特异性PCR芯片技术服务。公司采用基于MGB探针法、ARMS®技术的PCR检测平台,可以检测基因碱基突变。帮助您实现实验方案设计、芯片检测、数据分析,及后期功能研究的全套技术服务,并为您提供符合文献发表要求的数据报告。
     
     
     
    杏园生物检测基因突变的PCR芯片技术服务项目:
    乳腺癌体细胞突变(拷贝数变异)检测芯片
    结肠癌体细胞突变(拷贝数变异)检测芯片
    肺癌体细胞突变(拷贝数变异)检测芯片
    食管癌体细胞突变(拷贝数变异)检测芯片
    卵巢癌体细胞突变(拷贝数变异)检测芯片
    胃癌体细胞突变(拷贝数变异)检测芯片
    膀胱癌体细胞突变(拷贝数变异)筛查芯片
    软组织瘤体细胞突变(拷贝数变异)筛查芯片
    甲状腺癌体细胞突变(拷贝数变异)筛查芯片
    肝癌体细胞突变(拷贝数变异)检测芯片
    造血系统肿瘤体细胞突变(拷贝数变异)筛查芯片
    淋巴样肿瘤体细胞突变(拷贝数变异)筛查芯片
    胰腺癌体细胞突变(拷贝数变异)检测芯片
    头颈癌体细胞突变(拷贝数变异)检测芯片
    急性髓系白血病体细胞突变(拷贝数变异)检测芯片
    皮肤癌体细胞突变(拷贝数变异)检测芯片
    脑癌体细胞突变(拷贝数变异)检测芯片
    黑色素瘤体细胞突变(拷贝数变异)筛查芯片
    子宫内膜癌体细胞突变(拷贝数变异)筛查芯片
    前列腺癌体细胞突变(拷贝数变异)检测芯片
    骨髓增生异常综合征体细胞突变(拷贝数变异)筛查芯片

     检测基因突变的PCR芯片

     
    标题:FOXO/KLF6调控EGFR信号通路和治疗响应
     
    研究背景,研究结果和意义
        EGFR信号通路的激活是疾病进展的一个关键因素,所以也是很多治疗癌症药物的靶点。然而机体会通过不同的机制产生抗药性,例如AKT信号通路的激活。研究已经发现由于特异的分子损伤导致了抗EGFR治疗的耐药性,EGFR信号通路的下游分子可以被开发成新的分子药物靶标用来治疗已经产生耐药性的疾病。我们研究发现了一个转录调控网络包括抑癌因子KLF6和FOXO1,它们在体外培养的细胞和体内模型中可以负调控被激活的EGFR信号通路。此外,FDA批准的可以抑制FOXO1出核转运的药物TFP,在我们的体外培养细胞和肺癌的异种移植模型中通过调控KLF6/FOXO1信号通路减弱了对由AKT引起的厄洛替尼抗药性。综上所述,本研究发现了新的调控癌基因EGFR信号通路的转录调控网络,并且发现了一类FDA批准的药物通过恢复对抗EGFR治疗的化学敏感性来治疗转移性肺癌。
     
    技术平台相关背景和结果
         检测细胞系或者样品的基因突变是癌症研究和药物研发的关键内容之一,Real-time PCR是检测DNA突变的灵敏可靠的方法。通过将等位基因特异性扩增和水解探针检测相结合,突变位点特异的PCR芯片可以检测疾病相关或者信号通路相关的基因突变。



    Jaya Sangodkar, Neil S. Dhawan, et al. (2012). “Targeting the FOXO1/KLF6 axis regulates EGFR signaling and treatment response.” J Clin Invest.
    链接:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=22653055
    The Journal of Clinical Investigation是基础和临床生物医学领域的重要学术期刊之一,2014年影响因子是13.215。
     
     

    检测拷贝数变异的PCR芯片
     
     
    标题:人胰腺肿瘤异种移植模型的分子特性

    研究背景,研究结果和意义
         对于新的抗肿瘤药物的临床前评估需要有能真实反映人来源的原发肿瘤生物学和分子特性的模型。本研究比较了八例胰腺导管腺癌病人的肿瘤样本和相应的原发肿瘤移植到免疫缺陷的小鼠体内的移植物的分子特性。本研究采用拷贝数变异分析、基因表达分析、microRNA芯片、突变分析、短串联重复序列分析和免疫组化研究分子特性。短串联重复序列和突变分析发现异种移植物与原发肿瘤相比保持了比较高的基因组稳定性。拷贝数变异分析发现异种移植物在传代过程中都稳定保持1p, 3p, 4q, 6, 8p, 9, 10, 11q, 12p, 15q, 17, 18, 20p,
    和21染色体的缺失以及1q, 5p, 8q, 11q, 12q, 13q, 19q, and 20q染色体的获得。皮尔森相关性分析结果显示原发肿瘤和移植物之间的基因表达谱的相似度在0.88以上。所有样本的移植物在传代过程中保持基因表达模式的稳定性。在传代间发生差异的主要是基质间隔和炎症过程的基因。虽然在原发肿瘤和移植物之间存在一些差异,但在传代过程中基本保持稳定性。异种移植物在分子特性方面的稳定性使得该模型可以应用于药物筛选和其他深入研究。
     
    技术平台相关背景和结果
    拷贝数变异(Copy Number Variation, CNV)是基因组发生重排而导致的,一般指长度1kb以上的基因组大片段的拷贝数增加或者减少,主要表现为亚显微水平的缺失和重复。CNV包含的信息至少是SNP的三倍,因为CNV内部含有基因,所以它在人类疾病和药物应答中起重要的作用。呈孟德尔遗传的单基因遗传病及一些罕见复杂的疾病都与其相关,基因复制量改变、基因断裂、 融合及位置改变都可能是它的致病机理。基于Real-time PCR技术的PCR芯片可以检测疾病相关或者信号通路相关的基因拷贝数变化。
     
    技术路线

     
                Mike Mattie, Ashley Christensen, et al. “Molecular characterization of patient-derived human pancreatic tumor xenograft models for preclinical and translational development of cancer trerapeutics.”
    链接:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=24204193
    Neoplasia是Elsevier Science旗下专注于肿瘤学研究的杂志,2014年的影响因子是4.252。
     


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