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  • PCR芯片的应用以及与高通量测序技术的比较


    PCR芯片是一类将PCR引物固定在固定载体上的芯片。在生产过程中,将PCR引物进行各方面优化,包括引物特异性,引物扩增效率,引物Tm值等等。然后使用先进的点样技术,将PCR引物点在PCR板上(96孔板,384孔板或者微流控芯片的板子)。在实验环节,实验人员将抽提的核酸进行反转录成为cDNA,然后进行实时定量PCR扩增(采用芯片优化的mastermix),最后对产生的实验数据进行分析。在科学研究以及临床检测中可以有大量的应用。举例而言:
    1.      用于基因表达的检测。
                     i.          筛查某一疾病相关的基因,比如专注于肿瘤研究的科研人员,可以用它来筛查肺癌相关基因表达或者乳腺癌相关基因表达等等;上海杏园生物各种疾病相关的PCR芯片
                    ii.          筛查某一个生物学通路相关的基因,比如科研人员前期已经通过很多工作确定了要研究某一个信号通路,那么可以购买该通路相关的PCR芯片进行相关基因表达研究,比如EGFR信号通路、癌症相关信号通路等等。
                   iii.          表达谱芯片或者转录组测序的验证,表达谱芯片或者转录组测序产生的大量基因数据,生物学作用网络如果一个个验证,无疑费时费力,而且做得多了,难免出现交叉污染等现象。那么可以选择杏园生物的PCR芯片定制,一次性检测20个,40个甚至80个左右的基因表达。
    2.      用于基因突变的检测。
                     i.          筛查肿瘤相关的体细胞基因突变,杏园生物提供的肿瘤体细胞突变芯片都是经过文献和数据库查找的,多数至少有几千例样品的验证的结果;科研人员可以用来直接进行深入的研究,也可以用来进行临床的参考。

    1. 筛查基因相关的体细胞基因突变,杏园生物搜集了热点的体细胞突变基因位点,并采用Arms PCR的技术将其设计在一张芯片上。科研人员可以用来直接进行深入的研究。
    现在高通量测序这么火爆,我们还要做PCR芯片吗?
             作为一线临床诊断技术研究人员,我们知道,高通量测序技术一次性可以检测很多基因的突变,确实给科研和临床带来了很大的帮助。但是高通量测序技术却也有一个很严重的问题,就是可重复性并不让人满意。不同的实验室做出来的结果往往相差很大。即便同一个实验室做出来的,采用不同的数据分析方法都可以分析出来完全不同的实验结果。所以,目前为止,正规的临床检测或者是略有要求的科研实验室,在得到高通量测序的实验数据之后,都会采用传统的实验方法进行验证。
            而PCR技术在临床上的应用已经有很多年的历史了,这种技术已经被广泛认可。PCR芯片技术不管是单独应用还是和其他技术互相印证,都是很好的技术手段。杏园生物开发了一系列PCR芯片,广泛应用于各种疾病的研究。




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