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  • 如何进行肿瘤异质性的研究


    如何进行肿瘤异质性研究?


     
    肿瘤异质性适用于异质性的发现,肿瘤耐药性,化疗敏感性,肿瘤复发等多个阶段的研究。整体研究思路可概括如下:

    表型方面:首先收集肿瘤组织及正常组织或血液样本,进行高通量测序/表达谱分析等,初步获得突变及差异表达基因。分析上述基因,从中筛选出感兴趣基因,扩大样本量,对目标基因进一步验证,最终确定肿瘤中突变或差异表达基因。

    机制方面:首先确定所要研究的基因或突变,构建细胞及动物模型,在细胞水平上分析基因表达或发生突变时对肿瘤细胞功能的影响,如对细胞迁移侵袭能力的作用,或肿瘤细胞增殖能力等,探索该现象产生的相关分子机制或信号通路。并在动物实验上进一步验证细胞水平的结果,得到可靠的实验结论及其临床意义。
     
    肿瘤异质性的研究,针对不同的研究目的,可在数个不同的解决方案中进行选择。

    如果研究目的为在指定样品中鉴定新的基因突变,可使用全基因组或全外显子组测序,通过对基因组所有碱基的测序,对比正常与肿瘤组织,发现新的突变类型;
    如果研究目的为在指定样品中鉴定特定基因或所有基因的表达变化,可使用相应表达谱芯片,分析样品中基因表达量的变化,获得差异表达基因;
    如果研究目的为在指定样品中鉴定已知基因突变,可使用肿瘤热点基因突变芯片,SNP芯片等,确定样品的突变类型;
    如果研究目的为在指定样本中鉴定不同的细胞类群,可使用单细胞测序法,针对单个细胞进行全基因组扩增,对每个细胞的基因进行表达谱鉴定和分析;

    除此之外,还以针对肿瘤发生信号通路,miRNA, lncRNA等进行肿瘤异质性研究。




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