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甲基化特异性PCR (MSP)

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甲基化特异性PCR (MSP) 服务

重亚硫酸盐转化 + 甲基化/非甲基化引物

甲基化特异性PCR(Methylation-Specific PCR, MSP)是检测DNA甲基化的经典方法。DNA经重亚硫酸盐处理后,未甲基化胞嘧啶(C)转化为尿嘧啶(U),而甲基化胞嘧啶保持不变。设计针对甲基化(M)和非甲基化(U)序列的特异性引物,通过PCR扩增即可判断目标位点甲基化状态,具有快速、灵敏、无需特殊仪器的优势。

MSP · 核心优势

高灵敏度

可检测低至0.1%的甲基化等位基因,适用微量样本及早期筛查。

特异性强

针对甲基化/非甲基化序列分别设计引物,M和U两对引物交叉验证,结果可靠。

快速经济

无需测序或特殊设备,普通PCR仪+电泳即可完成,适合多样本筛查。

覆盖范围灵活

适用于单个或多个CpG位点检测,已知CpG岛启动子/增强子甲基化状态验证。

甲基化/非甲基化双引物设计 阳性/阴性对照严格质控 转化效率≥99.5%
MSP 标准化实验流程
1

DNA提取/纯化

高质量gDNA提取

2

重亚硫酸盐转化

未甲基化C→U

3

引物设计

甲基化/非甲基化特异性引物

4

PCR扩增

M管/U管平行扩增

5

电泳检测

琼脂糖凝胶判断条带

6

结果分析

甲基化状态判定+报告

技术规格与参数
检测原理重亚硫酸盐转化 + 甲基化特异性引物PCR
样本类型基因组DNA(组织、细胞、血液、FFPE、cfDNA等)
DNA起始量推荐100 ng-1 μg(可低至10 ng,经优化)
转化方法重亚硫酸盐化学转化(EpiTect / Zymo 等试剂盒)
转化效率≥99.5%(经内参基因评估)
引物设计甲基化(M)引物 / 非甲基化(U)引物套组
检测区域CpG岛、启动子、增强子等已知甲基化靶点
PCR平台普通热循环仪(ABI、Bio-Rad等)或qPCR仪(荧光MSP)
检测灵敏度可检出0.1%-1%甲基化等位基因比例
交付内容电泳图谱/扩增曲线、甲基化状态结果、实验报告
周期样本接收后5-7个工作日(常规项目)
结果判读与质控体系

甲基化判定标准

M引物扩增阳性 → 甲基化等位基因存在;U引物扩增阳性 → 非甲基化等位基因存在;两者同时阳性 → 部分甲基化。

严格质控措施

每批包含甲基化阳性对照(体外甲基化DNA)、非甲基化对照(正常人DNA)及无模板阴性对照,确保转化及扩增有效性。

荧光MSP(qMSP)可选

升级为实时荧光定量MSP,提供更直观的Ct值和定量甲基化比例(% of methylated reference)。

双重验证推荐

对于关键样本或标志物开发,可加做亚硫酸盐测序(BSP)或焦磷酸测序验证MSP结果,确保准确性。

广泛应用领域

肿瘤标志物筛查

抑癌基因启动子甲基化(如MGMT、p16、RASSF1A)检测,辅助肿瘤早期诊断及预后评估。

产前诊断

印记基因甲基化异常检测(如Prader-Willi综合征、Angelman综合征)。

表遗传学机制研究

特定基因/启动子甲基化状态与基因表达关联分析。

药物反应/耐药预测

甲基化标志物与化疗药物敏感性相关评估。

衰老/环境表观研究

年龄及环境因素引起特定基因甲基化变化检测。

植物表观遗传

植物胁迫响应及发育相关的甲基化检测。

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