

甲基化特异性PCR(Methylation-Specific PCR, MSP)是检测DNA甲基化的经典方法。DNA经重亚硫酸盐处理后,未甲基化胞嘧啶(C)转化为尿嘧啶(U),而甲基化胞嘧啶保持不变。设计针对甲基化(M)和非甲基化(U)序列的特异性引物,通过PCR扩增即可判断目标位点甲基化状态,具有快速、灵敏、无需特殊仪器的优势。
可检测低至0.1%的甲基化等位基因,适用微量样本及早期筛查。
针对甲基化/非甲基化序列分别设计引物,M和U两对引物交叉验证,结果可靠。
无需测序或特殊设备,普通PCR仪+电泳即可完成,适合多样本筛查。
适用于单个或多个CpG位点检测,已知CpG岛启动子/增强子甲基化状态验证。
高质量gDNA提取
未甲基化C→U
甲基化/非甲基化特异性引物
M管/U管平行扩增
琼脂糖凝胶判断条带
甲基化状态判定+报告
| 检测原理 | 重亚硫酸盐转化 + 甲基化特异性引物PCR |
|---|---|
| 样本类型 | 基因组DNA(组织、细胞、血液、FFPE、cfDNA等) |
| DNA起始量 | 推荐100 ng-1 μg(可低至10 ng,经优化) |
| 转化方法 | 重亚硫酸盐化学转化(EpiTect / Zymo 等试剂盒) |
| 转化效率 | ≥99.5%(经内参基因评估) |
| 引物设计 | 甲基化(M)引物 / 非甲基化(U)引物套组 |
| 检测区域 | CpG岛、启动子、增强子等已知甲基化靶点 |
| PCR平台 | 普通热循环仪(ABI、Bio-Rad等)或qPCR仪(荧光MSP) |
| 检测灵敏度 | 可检出0.1%-1%甲基化等位基因比例 |
| 交付内容 | 电泳图谱/扩增曲线、甲基化状态结果、实验报告 |
| 周期 | 样本接收后5-7个工作日(常规项目) |
M引物扩增阳性 → 甲基化等位基因存在;U引物扩增阳性 → 非甲基化等位基因存在;两者同时阳性 → 部分甲基化。
每批包含甲基化阳性对照(体外甲基化DNA)、非甲基化对照(正常人DNA)及无模板阴性对照,确保转化及扩增有效性。
升级为实时荧光定量MSP,提供更直观的Ct值和定量甲基化比例(% of methylated reference)。
对于关键样本或标志物开发,可加做亚硫酸盐测序(BSP)或焦磷酸测序验证MSP结果,确保准确性。
抑癌基因启动子甲基化(如MGMT、p16、RASSF1A)检测,辅助肿瘤早期诊断及预后评估。
印记基因甲基化异常检测(如Prader-Willi综合征、Angelman综合征)。
特定基因/启动子甲基化状态与基因表达关联分析。
甲基化标志物与化疗药物敏感性相关评估。
年龄及环境因素引起特定基因甲基化变化检测。
植物胁迫响应及发育相关的甲基化检测。