Full Moon BioSystems抗体阵列常见问题解答-结果相关问题

问：我的Western blot结果显示对照样本和处理样本之间有10倍的变化，但芯片结果显示的变化要小得多。这是正常的吗？
答：一般来说，芯片结果的倍数变化值比Western blot结果小得多。然而，变化趋势通常是一致的。

问：我的Western blot结果显示两个样本之间有很大的变化，但芯片结果显示没有变化。可能的原因是什么？
答：磷酸化芯片中的抗体识别磷酸化位点周围的特定残基。磷酸化抗体仅在蛋白质磷酸化时检测该蛋白质。非磷酸化抗体检测总蛋白质水平。抗体芯片实验中使用的蛋白质未经过变性处理，因此保留了它们的3D折叠结构。只有当特定残基暴露并可供结合时，这些蛋白质才会被抗体识别。如果样本中的某些蛋白质未被检测到，通常是因为结合残基不可接触。在其他情况下，蛋白质在磷酸化后可能立即与其他蛋白质形成复合物。这种现象可能会阻断磷酸化位点被抗体识别，从而导致蛋白质未被检测到。